会议期间，徐匡迪市长接见并宴请了十所大学校长。

1999年12月，中国大学校长联谊会’99论坛在南京大学隆重举行，来自祖国内地和香港的10所著名研究型大学的校长会聚一堂，分别以“面向21世纪如何建设高水平大学”和“大学如何加强科技创新、促进科技与经济社会发展相结合”为主题进行了专题讨论。

与会的大学校长们认为，面对即将到来的21世纪，承担着人才培养和科学研究双重使命的中国高等学校，尤其是联谊会成员必须不断增强创新能力，进一步加强交流与合作，发挥整体优势，更好地为科教兴国战略的实施做贡献。联谊会将继续通过召开周年学术大会、国际性学术会议，设立教学科研协调机构和信息中心，建设远程高等教育网络，出版会刊及专业期刊，设立奖励评审机制，邀请国际著名专家学者访问讲学等形式，加强高校的团结和协调，资源共享，相互支持，共同为中国培养高层次创新人才，发展前沿科学技术。

参加本次论坛的中国10所著名大学校长为（以校名第一个汉字笔画为序）：上海交通大学谢绳武、北京大学陈佳洱、西安交通大学徐通模、复旦大学王生洪、南京大学蒋树声、香港大学郑耀宗、香港中文大学李国章、香港科技大学吴家玮、浙江大学潘云鹤、清华大学王大中。

2001年9月，中国大学校长联谊会研讨会在西安交通大学举行。本次研讨会的主题是：作为世界一流大学的要求下，中国大学指标体系的内容及其建立。

参加本次研讨会的来宾有：清华大学王大中校长、北京大学许智宏校长、浙江大学潘云鹤校长、上海交通大学谢绳武校长、南京大学蒋树声校长、复旦大学孙莱祥副校长、香港大学戴义安校长、香港科技大学朱经武校长、香港中文大学李国章校长、西安交通大学徐通模校长。

2003年10月，中国大学校长联谊会杭州论坛在浙江大学拉开帷幕。教育部副部长吴启迪、浙江省副省长盛昌黎等出席开幕式。

国内各地包括香港地区十所著名大学的校长应邀参加本次论坛，他们分别是（按校名首字笔划排序）：上海交通大学校长谢绳武、北京大学校长许智宏、西安交通大学副校长阎健群、复旦大学校长王生洪、南京大学校长蒋树声、香港大学校长徐立之、香港中文大学校长金耀基、香港科技大学校长朱经武、浙江大学校长潘云鹤、清华大学校长顾秉林

面对科技飞速发展，国家现代化建设突飞猛进的21世纪，中国高等学校承担着人才培养和科学研究双重使命。论坛上，校长们就研究型高校如何不断增强创新能力，加强交流与合作，发挥整体优势，为科教兴国战略的实施、为国家现代化建设做出更大成绩等主题各抒己见。

2008年12月，中国大学校长联谊会2008年会暨校长论坛在香港中文大学举行，内地与香港10所创会大学的校长围绕“中国研究型大学如何发展成为世界一流大学”进行探讨。

国家教育部副部长吴启迪在会上作主题演讲，10所大学的校长轮流发表演说，分享治校发展策略，就达成世界一流大学的目标交换意见，并商讨联谊会未来发展方向。会后，各大学校长及代表到访香港科学园，了解香港科技发展的最新情况。

各成员大学共派出45位代表参加本次联谊会，包括清华大学校长顾秉林、复旦大学校长王生洪、香港中文大学校长刘遵义、上海交通大学校长张杰、北京大学校长周其凤、西安交通大学校长郑南宁、南京大学校长陈骏、香港大学校长徐立之、浙江大学校长杨卫、香港科技大学署理校长钱大康等。

2009年10月，中国大学校长联谊会2009年会暨校长论坛在西安交通大学举行。在本届年会上，中国大学校长联谊会理事会决定接纳中国科技大学和哈尔滨工业大学为联谊会成员。

时任联谊会会长、浙江大学校长杨卫院士讲话指出，适逢天时地利人和，中国高等教育的发展前景辉煌，中国大学校长联谊会增添了新的骨干成员，必将极大促进我们所致力的共同事业。

本次中国大学校长联谊会2009年会暨校长论坛的主题是“大学的学术权力与行政权力”。

2010年10月，“中国大学校长联谊会-2010”在复旦大学召开，12所中国顶级大学的“掌门人”全部到会。会议举行期间正逢世博，对于世博会和人才培养以及后世博的大学作为，这些大学“掌门人”们有着自己独到的见解。

会议围绕着“中国大学的内部治理模式”这一主题，北京大学、清华大学、复旦大学、中国科技大学、南京大学、浙江大学、上海交通大学、西安交通大学、哈尔滨工业大学、香港大学、香港中文大学、香港科技大学12所顶尖大学的掌门人进行了深入的交流研讨。

2012年10月，在浙江大学承办的2012中国大学校长联谊会上，来自C9高校和香港大学、香港中文大学、香港科技大学（9+3）的校长们，以“大学与文化的传承创新”为主题，进行了研讨。

社会观念、办学环境的改变，价值取向的多元化，互联网文化和海量信息的涌现等，给大学传承和创新文化带来新的机遇和挑战。

传播中国的文化，让世界了解中国，这是中国文化复兴的必然路径。在当前国际环境相当复杂的形势下，校长们认为，更要让世界了解我们的价值观，了解和认同我们的文化。

文化的传承与创新呼唤大学的教育改革，与会校长纷纷结合本校实际建言献策。

2013年10月，由中国科学技术大学承办的“中国大学校长联谊会-2013”在合肥召开。本次会议的主题是“信息化时代的教与学”，来自中国九所首批“985工程”高校（C9）和来自香港的三所高校（HK3）的校长就此议题展开了充分的交流和探讨。

12所大学的报告精彩纷呈，观点鲜明，视角丰富，呈现出很强的前瞻性与探索性。与会的各位校长在大会报告中就信息化时代对现代大学教育产生的重要影响进行了深入的剖析与探讨，并对信息时代里中国大学所面临的巨大挑战和机遇进行了深刻的思考。

报告中，各位大学领导者指出，21世纪是“知识爆炸”的信息化时代，大学生的生活习惯、知识结构和学习方式都发生了很大的变化，信息产业的发展加速了全球文化交流，推进了知识的传播，大规模开放式网络课程（Massive Open Online Course, MOOC）在世界范围内迅猛发展，对大学的传统教育模式带来强烈冲击。在此背景下，中国大学面临着巨大的挑战和机遇。大家纷纷围绕大学教育模式的改革展开积极的思考，以迎接信息化时代教育所带来的全新挑战。发言的各位校长从改革教学方法、创新学习模式、推进全新的课程体系建设等方面，畅谈了创新大学教育模式的方法和经验。同时，大会报告也对信息时代下中国大学的责任和努力方向进行了深入的交流和讨论。

2014年10月，“一流大学建设系列研讨会-2014暨中国大学校长联谊会”在清华大学主楼接待厅举行。9所首批获得“985工程”支持的高校和香港大学、香港中文大学、香港科技大学学校负责人，围绕“高等教育大众化阶段的一流大学建设”这一主题展开广泛而深入的研讨。

清华大学校长陈吉宁主持开幕式。清华大学党委书记陈旭，中国高等教育学会会长瞿振元，中国大学校长联谊会会长、上海交通大学校长张杰先后致辞。教育部部长助理、党组成员林蕙青作了特邀报告。

与会的高校负责人围绕“大学的分类管理与研究型大学定位”、“新高考方案下的社会公平与大学责任”和“创新驱动发展与大学的创意创新创业教育”3个分主题作了专题发言。

2015年10月，2015一流大学建设系列研讨会暨中国大学校长联谊会在南京大学仙林校区举行，来自内地及香港地区共12所知名高校的大学校长出席会议。南京大学校长陈骏院士主持开幕式。教育部副部长杜占元，江苏省副省长曹卫星，南京大学党委书记张异宾等出席开幕式。

本次研讨会以“新常态下的一流大学与一流学科建设”和“研究生培养阶段的创新创业教育”为主题，与会专家与学者就相关议题交换意见、深入讨论，纷纷提出富有远见的建设性意见。

2016年4月7日，在上海交通大学迎来建校120周年华诞前夕，“一流大学建设系列研讨会-2016”暨中国大学校长联谊会在上海交通大学举行。来自20多所海外有突出影响力的一流大学校长和国际大学联盟领袖，以及中国内地9所大学（C9）、香港和台湾的大学校长一起，围绕“研究型大学创新驱动发展战略与创新能力建设”主题展开对话，并就“大学培养创新型人才的有效措施”发表演讲。

为推动国际一流创新型大学建设，发挥大学在全球创新网络构建过程中的引领作用，本次论坛期间，中国C9高校加香港三所高校（H3）与澳大利亚八校联盟、欧洲研究型大学联盟、英国罗素大学集团联合签署了《上海宣言》意向书，呼吁全球创新型大学从人类命运共同体更为长远的利益出发，共同致力于更加创新的研究，培养创新人才、促进创新思维、联结创新网络，推动国际创新型大学用更开放的态度打造更密切、务实的合作关系，为一流创新型大学建设、人类社会发展掀开崭新的一页。

2017年5月21日下午，“一流大学建设系列研讨会-2017”暨中国大学校长联谊会在浙江大学求是大讲堂举行，大陆、香港12所顶尖大学的校长齐聚一堂，祝贺浙江大学建校120周年，共同探讨一流大学发展之路。

教育部高等教育司司长吴岩到会并讲话。北京大学校长林建华、复旦大学校长许宁生、上海交通大学校长林忠钦、西安交通大学校长王树国、香港大学校长马斐森、香港中文大学校长沈祖尧、香港科技大学校长陈繁昌、南京大学常务副校长吕建、中国科学技术大学常务副校长潘建伟、清华大学副校长尤政、哈尔滨工业大学副校长丁雪梅出席。浙江大学党委书记金德水出席会议并致辞，校长吴朝晖主持开幕式。

在之后召开的“9+3”校长联席会议上，大家审议通过本次会议的一项重要成果——《面向2030的“一流大学创新网络”合作倡议》，在构建创新人才培养合作网络、科学研究合作网络、知识转移和成果转化合作网络、文化传承与创新合作网络及融入全球教育与创新合作网络方面达成共识，推动创新要素和平台汇聚交融，通过协同联动和价值共创，孕育催生突破性的重大创新，向国家和区域创新生态系统辐射溢出，有力支撑创新型国家建设。

2018年10月12日，“一流大学建设系列研讨会—2018”暨中国大学校长联谊会在哈尔滨工业大学博物馆礼堂隆重召开。来自C9联盟高校和香港大学、香港中文大学、香港科技大学共12所高校的代表齐聚哈工大，深入贯彻落实全国教育大会精神，共话面向2030的中国教育现代化事业，共同探索教育强国和新时代中国特色世界一流大学的建设之路。

12所高校代表围绕“中国特色世界一流大学的建设路径和思考”“新时代高水平本科教育人才培养体系建设”“大学在国家创新体系中的角色和作用”3个主题分享了各高校在新时代创建中国特色世界一流大学新征程中的探索与实践。

2019年10月18日上午，由西安交通大学主办的“一流大学建设系列研讨会—2019”暨中国大学校长联谊会在中国西部科技创新港召开。来自C9联盟高校和香港大学、香港中文大学、香港科技大学共12所高校的代表齐聚渭水之滨，共商中国高等教育未来的发展，共同探索新时代中国特色世界一流大学的建设之路。

教育部学位管理与研究生教育司副司长徐忠波，北京大学校长郝平，南京大学校长吕建，浙江大学校长吴朝晖，中国科学技术大学校长包信和，哈尔滨工业大学校长周玉，北京大学校长助理张平文院士，清华大学副校长彭刚，复旦大学副校长金力，上海交通大学副校长奚立峰，南京大学副校长张峻峰，哈尔滨工业大学副校长丁雪梅，香港中文大学校长段崇智，香港大学副校长田之楠，香港科技大学首席副校长倪明选，环太平洋大学联盟秘书长楚明伟，西安交通大学党委书记张迈曾等出席研讨会。西安交通大学校长王树国主持开幕式。

会上，与会各校代表就相关议题交换意见、深入讨论、阐明观点，分享了各高校在新时代创建中国特色世界一流大学新征程中的探索与实践，围绕“更好迎接第四次工业革命”“大学与社会深度融合”“一流大学引领社会发展”等前沿问题，提出既关照当下又着眼未来的建设性意见。

2020年10月16-17日，一流大学建设系列研讨会-2020暨中国大学校长联谊会在广东省东莞市召开，此次会议由北京大学与香港中文大学共同承办。C9高校、香港大学、香港中文大学、香港科技大学的校长及代表出席会议，围绕“一流大学建设的总结和展望”“后疫情时代大学的责任和挑战”“一流大学服务区域经济社会发展”等三个主题展开交流与讨论，谋划中国高等教育的未来发展。教育部、广东省、东莞市有关领导出席开幕式。

在16日下午举行的中国大学校长联谊会上，与会的12所高校领导一致表示，在新的全球形势下，在后疫情时代，高校间要进一步加大合作交流的力度，协同创新，共同应对新的挑战。

2021年10月15日至16日，由复旦大学主办的一流大学建设系列研讨会-2021暨中国大学校长联谊会在上海青浦召开。教育部副部长翁铁慧、上海市委副书记于绍良等出席相关活动，C9大学、香港大学、香港中文大学、香港科技大学等校长及相关代表参会并作了报告。会议主要围绕“一流大学如何贯彻落实‘三新一高’发展战略”“一流大学在强化国家战略科技力量中的作用”“C9高校在培养一流人才方阵中的定位与贡献”等主题，开展了深入交流，形成了广泛共识。在中国大学校长联谊会上，吴朝晖当选为新一届会长。上一届会长是香港中文大学校长段崇智。

2023年5月25日至26日，由中国科学技术大学主办的一流大学建设系列研讨会—2022暨中国大学校长联谊会在中国科学技术大学高新校区举行。北京大学、清华大学、哈尔滨工业大学、复旦大学、上海交通大学、南京大学、浙江大学、西安交通大学、香港大学、香港中文大学、香港科技大学、澳门大学、澳门科技大学等14所高校校长、副校长齐聚合肥，在2022年度“一流大学建设系列研讨会”上共同探讨在“三位一体”建设框架下中国特色世界一流大学的建设之道。中国科学院副院长、党组成员周琪，中国大学校长联谊会理事会会长、浙江大学校长杜江峰分别发表致辞。西安交通大学校长王树国、清华大学校长王希勤、上海交通大学校长丁奎岭、复旦大学校长金力分别主持了14位校长报告。

2023年12月，经中国大学校长联谊会理事会审议，澳门大学正式加入“中国大学校长联谊会”（C9联盟+）。