理事会是会员代表大会的执行机构，在会员代表大会闭会期间领导该会开展日常工作，对会员代表大会负责。理事连续2次不出席理事会会议，自动丧失理事资格。

理事会的职权是：

（一）执行会员代表大会的决议；

该会设立常务理事会，常务理事会由理事会选举产生，在理事会闭会期间行使第二十二条第一、三、五、六、七、八、九项的职权，对理事会负责，常务理事人数不超过理事人数的1/3，常务理事连续3次不出席理事会会议，自动丧失常务理事资格。

该会设立监事会，监事任期与理事任期相同，期满可以连任。监事会由7名监事组成。监事会设监事长1名，由监事会推举产生。监事长和副监事长年龄不超过70周岁，连任不超过2届。

据2024年6月中国晶体学会官网显示，该学会设有11个专业委员会和2个工作委员会。

该会的会员包括个人会员和单位会员，个人会员包括普通会员、高级会员、会士、外籍会员。

申请加入该会的会员，必须具备下列条件：

（一）拥护该会的章程；

（二）有加入该会的意愿；

（三）在该会的学科领域内具有一定的影响。

（一）充分发挥晶体学学科交叉渗透的特点，积极组织国内外各项学术活动，进行广泛的学术交流，在学术活动中特别重视新发现、新发明、新观点与新理论，不断促进中国晶体学水平的发展与提高。

（一）会费；

2019年9月17日，由中国晶体学会小角散射专业委员会（筹）、中科院长春应化所主办，西南科技大学环境友好能源材料国家重点实验室承办的第一届全国小角散射学术会议在绵阳举行。

2019年10月21～24日，中国稀土学会稀土晶体专业委员会在上海市召开了第一届全国稀土晶体材料与应用研讨会暨稀土化学国际论坛。

2019年12月27～29日，中国稀土学会稀土晶体专业委员会青年工作委员会（青委会）第一次会议暨稀土晶体材料进展研讨会在云南昆明召开。

2023年7月15～18日，中国晶体学会、北京大学化学与分子工程学院共同主办的“中国晶体学会2023年单晶X射线衍射技术交流研讨会”在北京大学化学与分子工程学院举办。

2023年10月25日～26日，中国晶体学会2023年三维电子衍射技术研讨会在福州召开。

2024年1月23日～27日，中国晶体学会粉末X射线衍射技术研讨会在北京大学化学与分子工程学院召开。

2024年5月17日～19日，中国晶体学会首届陶瓷青年学术会议暨陶瓷材料、器件与装备国际研讨会”在景德镇陶瓷大学举办。

中国晶体学会青年科技奖是中国晶体学会设立并组织实施，面向全中国晶体学领域广大青年科技工作者的奖项。奖励在晶体学基础研究领域取得重要的、创新性的成就和作出突出贡献、在晶体学领域工程技术方面取得重大的、创造性的成果和作出贡献，并有显著应用成效、在晶体学领域科学技术普及、科技成果推广转化、科技管理工作中取得突出成绩，产生显著的社会效益或经济效益的集体和个人。

中国晶体学会青年科技奖每两年评选一次，每一届获奖人数不超过5 名，每人奖励人民币 2 万元。往届获奖者不重复授奖。

中国晶体学会宗旨是：坚持以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观、习近平新时代中国特色社会主义思想为指导。该会遵守社会道德风尚，遵循“百花齐放，百家争鸣”的方针，坚持实事求是的科学态度，团结、组织中国晶体学工作者积极开展国内外学术交流，加强科学道德和学风建设，紧密团结凝聚科学技术工作者在党的周围，以促进晶体学的繁荣发展，为实现中华民族伟大复兴的中国梦而努力奋斗。

该学会的会徽如图示：外圈双环中是该会中英文名称，内圆中是一个立体菱形晶体图案。

中国晶体学会历届理事长为：唐有祺、闵乃本、饶子和、林建华、高松、苏晓东。