南三镇地势平缓，中间较高，四周稍低，属滨海平原和滨海台地，最高点大岭海拔30.5米，地貌分为平原、滩涂、水域，其中浅海滩涂占28.2%。

南三镇四面临海，北面有南三河，西临湛江港，南面是广州湾航道，东面是南海。鉴江从本镇东北部出海。南三镇四周海域因地形的不同，潮差亦有不同。南面广州湾出海口狭隘，湾内潮差偏小，南三河出海口呈漏斗形和凹凸的海底地形而出现谐振，潮差由海湾外海的3～5米逐渐扩展到7米以上的大潮差。

南三镇主要自然灾害有洪涝、台风等。

南三镇有锐钛矿、电气石、褐铁矿、金红石、白太石、金云母和石英矿等地下资源，岛东部和南部还蕴藏天然气和石油。

截至2011年末，南三镇辖区总人口约9.2万。

截至2019年末，南三镇户籍人口为100540人。

2011年，南三镇地方财政总收入475万元，比上年增长15%。

2019年，南三镇有工业企业15个，其中规模以上企业有2个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市8个。

2011年，南三镇农业以种植业为主，农业总产值4.69亿元，比上年增长5.2%，农作物总播种面积8.8万亩，粮食作物种植面积共6.2万亩，总产量1.6万吨，水产品产量2.7万吨，水产养殖业产值4.4亿元，蔬菜总产量2.1万吨。

2011年，南三镇工业初步形成以制盐、榨油、酿酒、制作竹木器等工业为主均工业体系，全年产盐量达1200吨，比上年增长20%，工业总产值2732万元，比上年增长10%。

2011年，南三镇社会商品销售总额6.3亿元，比上年增长9.3%。

2011年末，南三镇有各类存款余额3.2亿元，比上年增长14.3%，各项贷款余额6300万元，比上年增长20.6%。

2011年，南三镇有邮政业务收入50万元，全年电信业务收入400万元。

2011年末，南三镇有幼儿园8所，在园幼儿1200人，专任教师10人；完全小学30所，分教点5个，在校生7200人，专任教师433人；初中3所，在校生4500人，专任教师259人，九年义务教育覆盖率达100%，财政预算内教育经费420万元，比上年增长10.5%。

2011年末，南三镇有镇文化中心1个，藏书1800册；村文化活动中心35个；农家书屋7个，藏书1.1万册。文艺社团6个，公共篮球场56个，足球场4个。群众体育组织2个。

2011年末，南三镇有各级各类医疗卫生机构23个，其中镇卫生院1所，村卫生站22个，专业卫生人员52名，其中执业医师20人，执业助理医师9人，注册护士25人，医疗机构完成诊疗5.3万人次。

2011年，南三镇核定低保对象2433人，五保户525人，孤儿177人，发放低保救助金292万多元，五保、孤儿供养支出费173万元。镇级敬老院1家，村级敬老院11个。国家抚恤、补助各类优抚对象274人，抚恤事业费支出85万元，新农保共参保3万人，城乡居民基本医疗保险已经覆盖7.5万人，农民参合率达94.83%。

2011年末，南三镇有邮政网点1个，全年征订报纸0.3万份、期刊0.15万册，电信企业1家，服务网点2个；电话交换机总容量3万门，固定电话用户0.6万户；移动电话用户3.2万户，互联网用户0.15万户。

2011年末，南三镇有110千伏变电站1座。

2011年末，南三镇有燃气企业1个，燃气销售网点4个，燃气普及率为65%。

2011年末，南三镇有南三贯岛公路，村道路95条，镇区现有道路总长5千米，主要有交通路、繁荣路、建新路、文明路、振兴路、东二路、兴华路、开发路、圩北路、建设路、镇中路、解放路；桥梁1座，已开通公交线路1条。

明洪武九年（1376年）四月，吴川县归属为高州府，吴川县将南部划为三个都，南一都、南二都、南三都。本镇当时属南三都，南三镇因此而得名。

南三镇古迹有广州湾靖海宫、越王祠。

南三镇有南三听涛景区，位于南三贯岛公路的终点，有长20千米，宽200~300米的沙滩长廊。