司内共设4个处，分别是：

（一）综合处

组织编制地质环境保护规划，参与水文地质、工程地质、环境地质勘查和科研规划及计划；负责地质环境管理综合统计工作，研究提出地质环境保护管理重大政策措施；负责司内重要会议和综合性文件的起草和司内行政事务性工作。

人员编制：4名。其中处长1名，副处长1名，其他工作人员2名。

（二）地质环境保护处

组织编制地质遗迹保护、地热和矿泉水资源开发利用专项规划，并对执行情况进行监督管理；管理国家级古生物化石产地、国家地质公园等地质遗迹保护地；负责地热、矿泉水资源调查评价和开发利用的监督管理；指导全国城市地质、农业地质、旅游地质等环境地质调查评价工作。

人员编制：2名。其中处长1名，其他工作人员1名。

（三）地质灾害防治处

组织、协调、指导和监督全国地质灾害防治工作；组织编制地质灾害防治规划并监督检查执行情况；组织建设全国地质灾害监测网络和预警信息系统；指导开展全国地质灾害气象预警预报工作；管理地质灾害防治勘查、设计、监理、施工和地质灾害危险性评估资质；拟订并组织实施国家突发地质灾害应急预案，建设国家突发地质灾害应急处置管理体系，组织开展重大地质灾害应急处置。

人员编制：3名。其中处长1名，其他工作人员2名。

（四）地质环境监测处

拟订全国地质环境监测、矿山地质环境保护和治理、地面沉降防治工作规划、技术规程和标准，并对执行情况进行监督管理；组织开展全国地质环境监测工作；负责全国水文地质、工程地质、环境地质勘查和地下水过量开采与污染的监测、监督等管理工作；负责矿业遗迹保护、矿山公园的监督管理。

人员编制：2名。其中处长1名，其他工作人员1名。