啮齿类的起源，一直是多年未解的问题。过去总以北美早始新世的副鼠为样板，推测啮齿类起源于古新世的灵长类。近年在我国发现的新材料证实，啮齿类应当起源于中亚：安徽潜山古新世地层中的东方晓鼠是啮齿类的祖先类型，内蒙古的磨楔齿鼠则是最原始的啮齿类。

从20世纪20年代起，动物学界一直认为鼠和兔没有系统关系，兔类可能起源于偶蹄类、古老的踝节类。直到70年代在安徽潜山与晓鼠一起发现了兔形类的祖先--模鼠兔，才算重新确认了鼠和兔的亲缘关系。