生态保护区为公园的主体，计有“佳仁山”、“雪山·大霸尖山”、“大剑山·佳阳山”、“台湾檫树”及“樱花钩吻鲑”五处，涵盖雪霸大部分的地区，大雪山、中雪山一带则因特殊的地形、地质景观，而被列为特别景观区。至于游憩区，则分别设在台中县的武陵以及新竹县的观雾。

登山是雪霸最热门的旅游活动，但入山证须事前规划办妥，方可尽兴成行。大霸尖山、雪山、武陵四秀为最热门的登山路线；大霸至雪山间的“圣棱线”，是一段险峰横阻、断崖处处的艰辛路程，向被岳界崇为高难度的挑战，沿途地质景观险恶多变，也最震撼人心。

四秀屏障在北、七家湾溪贯穿其间，使武陵充满了山水灵动之美。区内的游憩资源以退辅会的武陵农场，以及一条长度4.48公里、林相纷呈的森林浴步道为主；不论观山、观水、赏花、赏鸟，四时景色皆鲜活动人。本区因为“国宝”鱼——樱花钩吻鲑的最后栖息地，故而生态地位特殊。

观雾游憩区位于公园西北隅，以林务局观雾森林游乐区为中心，最具代表性的景观为大霸尖山至雪山间之圣棱线，而本区自然成为亲近大霸尖山的最佳入口。园区内拥有多种珍贵稀有的动植物，如台湾檫树、宽尾凤蝶、棣慕华凤仙花等，皆为列名的保育类动物。区内共有桧山神木步道、观雾瀑布步道、榛山步道、乐山林道、大鹿林道东线等5条游憩路线，步道上皆设有自导式解说设施，介绍园区内的鸟类、植物、地景等自然资源；其中，桧山神木每一株皆已千年以上，为台湾难得一见的红桧神木林。

雪霸国家公园汶水游客中心内设展示室及视听室，将园区地质、地形、动植物及人文景观资源，以浅显易懂的文字、生动精彩的图片画面呈现出来，游客在这里可以最短的时间了解国家公园概况。旁有八角形两层建筑，紧邻生态景观湖，视野极佳，并有简易餐饮以及国家公园出版品展售，是休憩或阅读自然的好场所。

雪见游憩区位于苗栗县泰安乡，居雪霸公园的西北隅，是园积极开发的重要游憩区之一。游憩区以二本松为中心，循司马限林道向北延伸至东洗水山一带，从雪山到大霸尖山一派壮阔的雪霸圣棱线高山景观，以及林道上的自然生态，是主要的游憩资源。

台湾樱花钩吻鲑——鲑科，台湾特有亚种，因体侧有樱花状花纹，雄鱼于繁殖期下吻增厚而呈上钩状而得名，须生活于水温摄氏16度以下、水质纯净之河流。原属洄游性的樱花钩吻鲑，因冰河时期结束、水温上升而被封在大甲溪上游；亦有学者持不同看法，认为兰阳溪才是樱花钩吻鲑的故乡，只是后来大甲溪袭夺了兰阳溪水源，把樱花钩吻鲑一并夺来，同时中断了鲑鱼的洄游之路。经过多年来的开垦，导致其生栖地破坏，鱼群急递减少，目前仅分布于武陵地区之七家湾溪上游，成为亟待复育的“国宝”鱼。

宽尾凤蝶——为台湾特有种，是濒临绝种的保育类动物，仅观雾及太平山台湾檫树生长区可见，前翅全黑，后翅具白斑，外缘有红色环纹，尾状凸出宽大，并有两条尾脉贯穿其间，为蝶类中独有，赏蝶期以7月为主。

棣慕华凤仙花——为台湾特有种，全世界仅分布于观雾地区，生长于林道边坡或林木下方阴暗潮湿处；叶椭圆形，花紫红色、漏斗状，果实具簧状构造，触之即裂开反卷并迸出种子，别具奇趣。

台湾檫树——樟科落叶乔木，台湾特有种，为冰河时期的遗孑，仅分布于观雾及太平山一带，园区内则见于观雾的马达拉溪林道旁。早春时开金黄色的花，秋冬时叶色转为深黄、橘红，极具观赏价值。由于种籽不易萌蘖，因而数量稀少，其叶为宽尾凤蝶之食草，裙带关系颇为密切。

雪霸公园在武陵游憩区设有游客中心，内有提供旅游资讯的服务台、播放公园简介、动植物生态特色的视听服务，及展出园区特色的环境教育区、游憩资讯区等。20人以上的团体于30天前预约，中心即提供解说服务。

武陵游憩区

1、由台中火车站前或丰原搭往武陵农场的丰原客运，于终点站下车。

2、由宜兰火车站旁或罗东搭往梨山的台汔客运，于武陵农场站下车。

观雾游憩区

目前并无公车可达，游客可由新竹市或竹东镇搭乘出租车辆。

观雾地区为山地经常管制区，进入前须先办妥甲种入山证；公园内的生态极须保护，除指定之游憩路线外，切勿进入其他地区。